MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2160076308 · doi:10.3324/haematol.11579

SBDS-deficient cells undergo accelerated apoptosis through the Fas-pathway

2008· article· en· W2160076308 sur OpenAlexaff
Piya Rujkijyanont, Kenichi Watanabe, Chhaya Ambekar, H. Wang, Aaron D. Schimmer, Joseph Beyene, Yigal Dror

Notice bibliographique

RevueHaematologica · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBlood disorders and treatments
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoPopulation Health Research InstituteOntario Institute for Cancer ResearchPrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisGene knockdownProgrammed cell deathCancer researchBone marrowSmall hairpin RNABiologyCell biologyImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Shwachman-Diamond syndrome is an inherited multisystem disorder characterized by bone marrow and pancreatic dysfunction as well as metaphyseal dysostosis. Ninety percent of the patients have mutations in the Shwachman-Bodian-Diamond syndrome gene (SBDS). The relationship between SBDS and cell survival is unknown. In this study we investigated whether deficiency of the SBDS protein can cause increased apoptosis and, if so, what pathways are involved in this process. DESIGN AND METHODS: To determine whether accelerated apoptosis of Shwachman-Diamond syndrome cells is caused by a deficiency in SBDS we generated two SBDS-knockdown cell clones. We then evaluated, Fas expression and levels of the intracellular proteins, BAX, BCL-2 and BCL-X(L) and determined the effects of apoptosis inhibitors. Using oligonucteotide-microarrays we also analyzed apoptosis-related gene expression in Shwachman-Diamond syndrome marrow cells. RESULTS: We found that knocking down SBDS by short interfering hairpin RNA in HeLa cells resulted in a prominent increase in cell death. The mechanism for the accelerated apoptosis was related to marked hypersensitivity to Fas stimulation, and increased Fas expression. In contrast, there was no increase in the expression ratio of the pro-apoptotic factor, BAX, to the pro-survival factors, BCL2 and BCL-X(L) in the SBDS-knockdown cells and in the patients' marrow cells. Furthermore, inhibition of Fas and caspase 8, but not caspase 9, significantly improved the defective cell growth phenotype. CONCLUSIONS: Our work provides new data about the pro-survival properties of SBDS, whose inhibition results in accelerated apoptosis through the Fas pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,285
Score d'incertitude au seuil0,505

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHaematologicaMême sujetBlood disorders and treatmentsTravaux en français237 207