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Enregistrement W2160135068 · doi:10.1139/g05-017

Evolution of genome size across some cultivated <i>Allium</i> species

2005· article· en· W2160135068 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNuclear DNAAlliumGenome sizeAmaryllidaceaeSubgenusBotanyBulbPloidyPhylogenetic treeGC-contentPhylogeneticsGenusGenomeGeneticsGeneMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Allium L. (Alliaceae), a genus of major economic importance, exhibits a great diversity in various morphological characters and particularly in life form, with bulbs and rhizomes. Allium species show variation in several cytogenetic characters such as basic chromosome number, ploidy level, and genome size. The purpose of the present investigation was to study the evolution of nuclear DNA amount, GC content, and life form. A phylogenetic approach was used on a sample of 30 Allium species, including major vegetable crops and their wild allies, belonging to the 3 major subgenera Allium, Amerallium, and Rhizirideum and 14 sections. A phylogeny was constructed using internal transcribed spacer (ITS) sequences of 43 accessions representing 30 species, and the nuclear DNA amount and the GC content of 24 Allium species were investigated by flow cytometry. For the first time, the nuclear DNA content of Allium cyaneum and Allium vavilovii was measured, and the GC content of 16 species was measured. We addressed the following questions: (i) Is the variation in nuclear DNA amount and GC content linked to the evolutionary history of these edible Allium species and their wild relatives? (ii) How did life form (rhizome or bulb) evolve in edible Allium? Our results revealed significant interspecific variation in the nuclear DNA amount as well as in the GC content. No correlation was found between the GC content and the nuclear DNA amount. The reconstruction of nuclear DNA amount on the phylogeny showed a tendency towards a decrease in genome size within the genus. The reconstruction of life form history showed that rhizomes evolved in the subgenus Rhizirideum from an ancestral bulbous life form and were subsequently lost at least twice independently in this subgenus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,546

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations121
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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