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Enregistrement W2160141477 · doi:10.1094/pdis.2000.84.5.595a

First Report of <i>Barley yellow streak mosaic virus</i>-Infected Barley in Alaska

2000· article· en· W2160141477 sur OpenAlexaboutno aff
N. L. Robertson, Sue Brumfield

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNicotiana benthamianaHordeum vulgareBiologyAntiserumPlant virusPolyclonal antibodiesInoculationWestern blotVirusImmunoelectron microscopyGel electrophoresisBotanyVirologyMolecular biologyPoaceaeHorticultureAntibodyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Barley yellow streak mosaic virus (BaYSMV) was first described and reported in Montana and Alberta, Canada, more than 17 years ago (1). Since then, it has been detected in two other locations: Pocatello Valley, ID (3), and across the border in Utah. BaYSMV has now been found in the Alaskan interior. In July 1999, dry-land barley (Hordeum vulgare L.) growing in University of Alaska-Fairbanks experimental plots exhibited symptoms similar to those described for BaYSMV, including parallel chlorotic streaks and leaf banding. Mechanical inoculation of Nicotiana benthamiana with diseased barley sap produced systemic mosaic symptoms. As previously reported for BaYSMV sap-transmission tests (2), parallel inoculations to barley plants yielded no symptoms. Electron microscopy of leaf dips and minipurifications of infected N. benthamiana revealed long filamentous particles that matched the size and shape reported for BaYSMV (1). Ultrathin sections of diseased barley and N. benthamiana leaves displayed characteristic virus particles. BaYSMV was confirmed by immuno-sorbent electron microscopy assays (4) and western blot analysis with polyclonal antiserum. Long filamentous BaYSMV particles appeared only on grids coated with BaYSMV antiserum and exposed to diseased N. benthamiana sap. Total protein extracts from diseased barley tissue and inoculated N. benthamiana, as well as with protein extracted from partially purified preparations, were applied to a 12% sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis minigel and stained with Coomassie blue. Diseased samples, but not healthy controls, contained a protein of ≈33 kDa that was within the size range of a previously described protein from partially purified BaYSMV particles (2). Western blot analysis with an Immuno-Blot alkaline phosphatase assay system (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA) confirmed that the protein reacted with polyclonal BaYSMV. This is the first serological documentation of a BaYSMV-specific protein and that the ≈33-kDa protein is the main antigen recognized by the BaYSMV polyclonal antiserum. Based on virus particle shape and size, symptomology, mechanical transmission host range, and serology, we conclude that BaYSMV is associated with the barley disease observed. Barley yellow streak mosaic virus disease outbreaks are associated with recurring drought and are accompanied by infestations of the brown wheat mite vector, Petrobia latens Müller (1), so it is not surprising that this report coincides with abnormally dry conditions occurring throughout the 1990s in the interior of Alaska. References: (1) N. L. Robertson and T. W. Carroll. Science 240:1188, 1988. (2) N. L. Robertson and T. W. Carroll. Plant Dis. 75:839, 1991. (3) J. S. Skaf et al. Plant Dis. 76:861, 1992. (4) J. S. Skaf and T. W. Carroll. Plant Dis. 79:1003, 1995.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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