Identification of a mutation in the Indian Hedgehog (<i>IHH</i>) gene causing brachydactyly type A1 and evidence for a third locus
Notice bibliographique
Résumé
Brachydactyly (BD) is a term used to describe inherited anomalies of the hands generally characterised by shortened phalanges or metacarpals. Initially, the brachydactylies were grouped into five different classes (A-E), with three subtypes of A.1 Later work revised and extended the classification of BD.2,3 In type A, shortening is primarily confined to the middle phalanges. Subtype A1 (BDA1, OMIM 112500) is distinguished by hypoplastic middle phalanges (especially the 2nd and 5th digits), with either distal or terminal symphalangism depending on the severity. In addition, shortening of the proximal phalanges of the thumb, the metacarpals, metatarsals, or the big toe are also observed in these patients. Short stature is often associated with BDA1 patients. Despite being the first syndrome described with Mendelian autosomal dominant inheritance in 1903,4, the genetic aetiology of BDA was not reported until 2001.5 Suspecting that cell proliferation or differentiation factors could be the culprit causing BDA1, our group screened markers near several candidate genes in two families diagnosed with BDA1. No linkage was observed.6 We also chose to look for mutations of the PAX3 genes in these families by direct sequencing of all the exons, but no significant mutation was identified (unpublished data). In 2000, a locus for BDA1 was mapped to 2q35-q36 in two unrelated Chinese families.7 Refined mapping and mutation screening of candidate genes in the region by the same group identified missense mutations in the Indian Hedgehog gene ( IHH) of the affected subjects in three unrelated families.5 The missense mutations, located at the amino terminus of the IHH protein, are conserved among the Hedgehog family proteins. Local and long range cell proliferation signalling functions were suggested to reside within the amino-terminus domain. Interestingly, ROR2 and CDMP1 have been identified to cause brachydactyly types B and …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».