MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2160234947 · doi:10.1177/104063870802000416

A Collaborative Canadian-United Kingdom Evaluation of an Immunohistochemistry Protocol to Diagnose Bovine Spongiform Encephalopathy

2008· article· en· W2160234947 sur OpenAlexaffabout
Lisa Manning, Katherine I. O’Rourke, Donald P. Knowles, Sarah Marsh, Y. I. Spencer, Estella Moffat, G. A. H. Wells, Stefanie Czub

Notice bibliographique

RevueJournal of Veterinary Diagnostic Investigation · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensCanadian Science Centre for Human and Animal Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBovine spongiform encephalopathyHistopathologyImmunohistochemistryMedicinePathologyPrion proteinDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collaboration was established in 2001 to evaluate a commercially available immunohistochemistry assay kit for the detection of bovine spongiform encephalopathy (BSE) disease-associated prion protein in formic acid-treated formalin-fixed samples of bovine brain. The kit protocol was evaluated at the National Centre for Foreign Animal Diseases (Winnipeg, Canada) and the Veterinary Laboratories Agency (Weybridge, U.K.). The U.K. laboratory provided paraffin-embedded blocks of brainstem (medulla oblongata at the level of the obex) from 100 positive cases defined by clinical signs and histopathology, and 100 clinically suspect but BSE-negative samples defined by histopathology and immunohistochemistry with anti-PrP monoclonal antibody R145. The Canadian laboratory provided 400 blocks from surveillance cases defined as clinically suspect but negative by histopathology and immunohistochemistry with anti-PrP antibody 6H4. Consecutive sections from each block were cut and coded. Each set of 600 slides was immunolabeled and read in each laboratory. Evaluation parameters included estimates of diagnostic sensitivity and specificity and reproducibility of the results. The kit performed with 100% sensitivity, specificity, and reproducibility in spite of minor differences between the laboratories in brain sample areas, fixation and processing, and in the immunolabeling protocol. Although enzyme linked immunosorbent assays are widely used in high throughput surveillance programs, standardized protocols and reagents for manual immunohistochemistry provide a useful adjunct to surveillance efforts, particularly in laboratories testing small numbers of samples or using immunohistochemistry for confirmation and characterization of BSE cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Veterinary Diagnostic InvestigationMême sujetPrion Diseases and Protein MisfoldingTravaux en français237 207