Overexpression of transcripts originating from the MMSET locus characterizes all t(4;14)(p16;q32)-positive multiple myeloma patients
Notice bibliographique
Résumé
Multiple myeloma (MM) is a B-lineage malignancy characterized by diverse genetic subtypes and clinical outcomes. The recurrent immunoglobulin heavy chain (IgH) switch translocation, t(4;14)(p16;q32), is associated with poor outcome, though the mechanism is unclear. Quantitative reverse-transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) for proposed target genes on a panel of myeloma cell lines and purified plasma cells showed that only transcripts originating from the WHSC1/MMSET/NSD2 gene are uniformly dysregulated in all t(4;14)POS patients. The different transcripts detected, multiple myeloma SET domain containing protein (MMSET I), MMSET II, Exon 4a/MMSET III, and response element II binding protein (RE-IIBP), are produced by alternative splicing and alternative transcription initiation events. Translation of the various transcripts, including those from major breakpoint region 4-2 (MB4-2) and MB4-3 breakpoint variants, was confirmed by transient transfection and immunoblotting. Green fluorescent protein (GFP)-tagged MMSET I and II, corresponding to proteins expressed in MB4-1 patients, localized to the nucleus but not nucleoli, whereas the MB4-2 and MB4-3 proteins concentrate in nucleoli. Cloning and localization of the Exon 4a/MMSET III splice variant, which contains the protein segment lost in the MB4-2 variant, identified a novel protein domain that prevents nucleolar localization. Kinetic studies using photobleaching suggest that the breakpoint variants are functionally distinct from wild-type proteins. In contrast, RE-IIBP is universally dysregulated and also potentially functional in all t(4;14)POS patients irrespective of fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3) expression or breakpoint type.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».