Characterization of a novel alloherpesvirus from Atlantic cod ( <i>Gadus morhua</i> )
Notice bibliographique
Résumé
Alloherpesviruses affect freshwater and marine fish species. The aim of the current study was to characterize a novel alloherpesvirus in Atlantic cod (Gadus morhua). Samples were processed for histopathology, transmission electron microscopy (TEM), virus isolation, molecular characterization, and in situ hybridization (ISH). Histopathology revealed that the infection was restricted to the gills and that it induced cytomegaly in infected cells. By TEM, numerous viral particles with morphology compatible with a herpesvirus were observed inside the cytomegalic cells. To characterize this new agent, polymerase chain reaction amplified regions of the ATPase subunit of the terminase, and DNA polymerase genes were sequenced. Phylogenetic analysis revealed strongest similarity with alloherpesviruses belonging to the genus Ictalurivirus and Salmonivirus. The ISH showed specific labeling of nuclear inclusions in the cytomegalic cells. While virus isolation was unsuccessful, the results obtained through different diagnostic tests in the present study confirm the discovery of a new alloherpesvirus affecting Atlantic cod. The authors propose the formal species designation Gadid herpesvirus 1 (GaHV-1) to be considered for approval by the International Committee on the Taxonomy of Viruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».