Methodological considerations for analyzing trabecular architecture: an example from the primate hand
Notice bibliographique
Résumé
Micro-computed tomographic analyses of trabecular bone architecture have been used to clarify the link between positional behavior and skeletal anatomy in primates. However, there are methodological decisions associated with quantifying and comparing trabecular anatomy across taxa that vary greatly in body size and morphology that can affect characterizations of trabecular architecture, such as choice of the volume of interest (VOI) size and location. The potential effects of these decisions may be amplified in small, irregular-shaped bones of the hands and feet that have more complex external morphology and more heterogeneous trabecular structure compared to, for example, the spherical epiphysis of the femoral head. In this study we investigate the effects of changes in VOI size and location on standard trabecular parameters in two bones of the hand, the capitate and third metacarpal, in a diverse sample of nonhuman primates that vary greatly in morphology, body mass and positional behavior. Results demonstrate that changes in VOI location and, to a lesser extent, changes in VOI size had a dramatic affect on many trabecular parameters, especially trabecular connectivity and structure (rods vs. plates), degree of anisotropy, and the primary orientation of the trabeculae. Although previous research has shown that some trabecular parameters are susceptible to slight variations in methodology (e.g. VOI location, scan resolution), this study provides a quantification of these effects in hand bones of a diverse sample of primates. An a priori understanding of the inherent biases created by the choice of VOI size and particularly location is critical to robust trabecular analysis and functional interpretation, especially in small bones with complex arthroses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,016 | 0,033 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».