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Enregistrement W2160482646 · doi:10.1091/mbc.e12-02-0114

Alternative splicing results in RET isoforms with distinct trafficking properties

2012· article· en· W2160482646 sur OpenAlexafffund
Douglas S. Richardson, David M. Rodrigues, Brandy D. Hyndman, Mathieu J. F. Crupi, Adrian C. Nicolescu, Lois M. Mulligan

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensKingston General HospitalQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Institute
Mots-clésBiologyCell biologyAutophosphorylationGene isoformProtein kinase ASignal transductionReceptor tyrosine kinaseGolgi apparatusAlternative splicingKinaseSignal transducing adaptor proteinEndoplasmic reticulumBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RET encodes a receptor tyrosine kinase that is essential for spermatogenesis, development of the sensory, sympathetic, parasympathetic, and enteric nervous systems and the kidneys, as well as for maintenance of adult midbrain dopaminergic neurons. RET is alternatively spliced to encode multiple isoforms that differ in their C-terminal amino acids. The RET9 and RET51 isoforms display unique levels of autophosphorylation and have differential interactions with adaptor proteins. They induce distinct gene expression patterns, promote different levels of cell differentiation and transformation, and play unique roles in development. Here we present a comprehensive study of the subcellular localization and trafficking of RET isoforms. We show that immature RET9 accumulates intracellularly in the Golgi, whereas RET51 is efficiently matured and present in relatively higher amounts on the plasma membrane. RET51 is internalized faster after ligand binding and undergoes recycling back to the plasma membrane. This differential trafficking of RET isoforms produces a more rapid and longer duration of signaling through the extracellular-signal regulated kinase/mitogen-activated protein kinase pathway downstream of RET51 relative to RET9. Together these differences in trafficking properties contribute to some of the functional differences previously observed between RET9 and RET51 and establish the important role of intracellular trafficking in modulating and maintaining RET signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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