Elucidation of the molecular structure of lipid A isolated from both a rough mutant and a wild strain of <i>Aeromonas salmonicida</i> lipopolysaccharides using electrospray ionization quadrupole time‐of‐flight tandem mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
The chemical structure of lipid A, isolated by mild acid hydrolysis from a rough mutant and a wild strain of Aeromonas salmonicida lipopolysaccharide, was investigated using electrospray ionization quadrupole time-of-flight (QqToF) hybrid tandem mass spectrometry and showed a great degree of microheterogeneity. The chemical structure of the main constituent of this heterogeneous mixture was identified as a beta-D-(1 --> 6) linked D-glucosamine disaccharide substituted by two phosphate groups, one being bound to the non-reducing end at position O-4' and the other to the position O-1 of the reducing end of the D-glucosamine disaccharide. The location of the fatty acids linked to the disaccharide backbone was established by identifying diagnostic ions in the conventional QqToF-MS scan. Low-energy collision tandem mass spectrometry analysis of the selected precursor diagnostic ions confirmed, unambiguously, their proposed molecular structures. We have established that myristyloxylauric (C14:0(3-O(12:0))) acid residues were both N-2' and O-3' linked to the non-reducing end of the D-GlcN residue, and that two 3-hydroxymyristic (C14:0(3-OH)) acid chains acylated the remaining positions of the reducing end. The MS and MS/MS data obtained allowed us to determine the complex molecular structure of lipid A. The QqToF-MS/MS instrument has shown excellent superiority over a conventional quadrupole-hexapole-quadrupole tandem instrument which failed to fragment the selected precursor ion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».