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Enregistrement W2160495202 · doi:10.1186/1756-9966-32-44

Blood RNA biomarker panel detects both left- and right-sided colorectal neoplasms: a case-control study

2013· article· en· W2160495202 sur OpenAlexaff
Samuel T. Chao, Jay Ying, Gailina Liew, W. Marshall, Choong‐Chin Liew, Robert Burakoff

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental & Clinical Cancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Screening and Detection
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColorectal cancerBiomarkerOncologyInternal medicinePathologyBiologyGeneticsCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Colonoscopy is widely regarded to be the gold standard for colorectal cancer (CRC) detection. Recent studies, however, suggest that the effectiveness of colonoscopy is mostly confined to tumors on the left side of the colon (descending, sigmoid, rectum), and that the technology has poor tumor detection for right-sided (cecum, ascending, transverse) lesions. A minimally invasive test that can detect both left-sided and right-sided lesions could increase the effectiveness of screening colonoscopy by revealing the potential presence of neoplasms in the right-sided "blind spot". METHODS: We previously reported on a seven-gene, blood-based biomarker panel that effectively stratifies a patient's risk of having CRC. For the current study, we assessed the effectiveness of the seven-gene panel for the detection of left- and right-sided CRC lesions. Results were evaluated for 314 patients with CRC (left-sided: TNM I, 65; TNM II, 57; TNM III, 60; TNM IV, 17; unknown, 9. right-sided: TNM I, 28; TNM II, 29; TNM III, 38; TNM IV, 12; unknown, 1 and including two samples with both left and right lesions) and 328 control samples. Blood samples were obtained prior to clinical staging and therapy. Most CRC subjects had localized disease (stages I and II, 58%); regional (stage III) and systemic (stage IV) disease represented 32% and 9%, respectively, of the study population. RESULTS: The panel detected left-sided (74%, 154/208) and right-sided (85%, 92/108) lesions with an overall sensitivity of 78% (215/316) at a specificity of 66% (215/328). Treatable cancer (stages I to III) was detected with left-sided lesion sensitivity of 76% (138/182) and right-sided sensitivity of 84% (80/95). CONCLUSION: This seven-gene biomarker panel detected right-sided CRC lesions across all cancer stages with a sensitivity that is at least equal to that for left-sided lesions. This study supports the use of this panel as the basis for a patient-friendly, blood-based test that can be easily incorporated into a routine physical examination in advance of colonoscopy to provide a convenient companion diagnostic and a pre-screening alert, ultimately leading to enhanced CRC screening effectiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,136
Tête enseignante GPT0,462
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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