Iha from an <i>Escherichia coli</i> Urinary Tract Infection Outbreak Clonal Group A Strain Is Expressed In Vivo in the Mouse Urinary Tract and Functions as a Catecholate Siderophore Receptor
Notice bibliographique
Résumé
Virulence factors of pathogenic Escherichia coli belonging to a recently emerged and disseminated clonal group associated with urinary tract infection (UTI), provisionally designated clonal group A (CGA), have not been experimentally investigated. We used a mouse model of ascending UTI with CGA member strain UCB34 in order to identify genes of CGA that contribute to UTI. iha was identified to be expressed by strain UCB34 in the mouse kidney using selective capture of transcribed sequences. iha from strain UCB34 demonstrated a siderophore receptor phenotype when cloned in a catecholate siderophore receptor-negative E. coli K-12 strain, as shown by growth promotion experiments and uptake of (55)Fe complexed to enterobactin or its linear 2, 3-dihydroxybenzoylserine (DHBS) siderophore derivatives. Siderophore-mediated growth promotion by Iha was TonB dependent. Growth and iron uptake were more marked with linear DHBS derivatives than with purified enterobactin. The reported phenotype of adherence to epithelial cells conferred by expressing iha from a multicopy cloning vector in a poorly adherent E. coli K-12 host strain was confirmed to be specific to iha, in comparison with other siderophore receptor genes. iha expression was regulated by the ferric uptake regulator Fur and by iron availability, as shown by real-time reverse transcriptase PCR. In a competitive infection experiment using the mouse UTI model, wild-type strain UCB34 significantly outcompeted an isogenic iha null mutant. Iha thus represents a Fur-regulated catecholate siderophore receptor that, uniquely, exhibits an adherence-enhancing phenotype and is the first described urovirulence factor identified in a CGA strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».