<i>KIF1C</i> mutations in two families with hereditary spastic paraparesis and cerebellar dysfunction
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hereditary spastic paraparesis (HSP) (syn. Hereditary spastic paraplegia, SPG) are a group of genetic disorders characterised by spasticity of the lower limbs due to pyramidal tract dysfunction. Nearly 60 disease loci have been identified, which include mutations in two genes (KIF5A and KIF1A) that encode motor proteins of the kinesin superfamily. Here we report a novel genetic defect in KIF1C of patients with spastic paraparesis and cerebellar dysfunction in two consanguineous families of Palestinian and Moroccan ancestry. METHODS AND RESULTS: We performed autozygosity mapping in a Palestinian and classic linkage analysis in a Moroccan family and found a locus on chromosome 17 that had previously been associated with spastic ataxia type 2 (SPAX2, OMIM %611302). Whole-exome sequencing revealed two homozygous mutations in KIF1C that were absent among controls: a nonsense mutation (c.2191C>T, p.Arg731*) that segregated with the disease phenotype in the Palestinian kindred resulted in the entire absence of KIF1C protein from the patient's fibroblasts, and a missense variant (c.505C>T, p.Arg169Trp) affecting a conserved amino acid of the motor domain that was found in the Moroccan kindred. CONCLUSIONS: Kinesin genes encode a family of cargo/motor proteins and are known to cause HSP if mutated. Here we identified nonsense and missense mutations in a further member of this protein family. The KIF1C mutation is associated with a HSP subtype (SPAX2/SAX2) that combines spastic paraplegia and weakness with cerebellar dysfunction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».