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Enregistrement W2160554882 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0144

Associations of Ki-<i>ras</i> Proto-oncogene Mutation and p53 Gene Overexpression in Sporadic Colorectal Adenomas with Demographic and Clinicopathologic Characteristics

2006· article· en· W2160554882 sur OpenAlexaff
Janine G. Einspahr, Marı́a Elena Martı́nez, Ruiyun Jiang, Chiu‐Hsieh Hsu, Achyut K. Bhattacharrya, Dennis J. Ahnen, Elizabeth T. Jacobs, Patrick Houlihan, C. Renee Webb, David S. Alberts, Stanley R. Hamilton

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésDysplasiaAdenomaInternal medicineMutationAdenocarcinomaOdds ratioColorectal adenomaGastroenterologyCarcinogenesisHistologyOncogeneBiologyMedicineColorectal cancerCancer researchOncologyPathologyCancerGeneCell cycleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In colorectal tumorigenesis, Ki-ras proto-oncogene mutation often occurs early in the adenoma-adenocarcinoma sequence, whereas mutation of the p53 gene is associated with late progression to carcinoma. We evaluated the relationship of demographic and clinicopathologic characteristics to Ki-ras mutation and p53 gene product overexpression in 1,093 baseline sporadic colorectal adenomas from 926 individuals enrolled in a phase III recurrence prevention trial. Ki-ras mutation was found in 14.7% of individuals and p53 overexpression was found in 7.0% of those tested. Multivariate analysis found older age, rectal location, and villous histology to be independently associated with Ki-ras mutation. Individuals with an advanced adenoma (>or=1 cm or high-grade dysplasia or villous histology) had a 4-fold higher likelihood of Ki-ras mutation [odds ratios (OR), 3.96; 95% confidence intervals (CI), 2.54-6.18]. Ki-ras mutations in codon 12 and of the G-to-A transition type were more frequent in older individuals, whereas G-to-T transversion was more frequent in rectal adenomas than in the colon. Multivariate analysis showed that previous history of a polyp (P = 0.03) was inversely associated with p53 overexpression. Large adenoma size (>or=1 cm), high-grade dysplasia, and villous histology were independently associated with p53 overexpression, with the strongest association for advanced adenomas (OR, 7.20; 95% CI, 3.01-17.22). Individuals with a Ki-ras mutated adenoma were more likely to overexpress p53 (OR, 2.46; 95% CI, 1.36-4.46), and 94.8% of adenomas with both alterations were classified as advanced (P

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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