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Enregistrement W2160613473 · doi:10.1111/j.1439-0388.2007.00628.x

The polymorphism in MUC1 gene in Nelore cattle

2007· article· en· W2160613473 sur OpenAlex
Fábio Ricardo Pablos de Souza, Daniel Blasioli Dentillo, Juliana Meola, Fernando H. Biase, María Andrea, Pedro Alejandro Vozzi, R B Lobo, Lúcia Martelli

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Breeding and Genetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésBiologyGeneticsTandem repeatVariable number tandem repeatGeneExonGenBankMinisatellitePolymerase chain reactionAlleleMolecular biologyMicrosatelliteGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MUC1 is a transmembrane glycoprotein expressed on the apical surfaces of the uterine epithelial tissue with predicted functions in protection and cell-cell adhesion. These properties are closely related with the repetitive region [variable number of tandem repeats (VNTR)] of the extracellullar domain and with the O-glycosylation in their serine and threonine residues. This study describes a polymerase chain reaction (PCR) protocol to analyse MUC1 bovine genetic polymorphism and demonstrates the existence of a VNTR within the sites for O-glycosylation. Oligonucleotide primers based on the Bos taurus mucin (MUC1) gene sequence GenBank AF399757 were used to amplify five VNTR MUC1 alleles from a study group of 56 pure Nelore bovines. The number of repeats varied between 10 and 24, being more prevalent than the alleles with less number of repeats. The DNA sequence analysis revealed two repeats and one of them presented 100% homology with the bovine consensus sequence already reported. The second repeat showed codons that translate to serine and proline amino acids, which are conserved in the MUC1 of several species. This study is the first description of allelic variation and the VNTR structure in the Nelore breed MUC1 gene, and we suggest that this genetic variability can be tested for association with variation in reproductive traits in Nelore cattle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,760
Score d'incertitude au seuil0,311

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle