Molecular cloning, sequencing, and chromosome mapping of a 1A-encoded ω-type prolamin sequence from wheat
Notice bibliographique
Résumé
Gliadins are the most abundant component of the seed storage proteins in cereals and, in combination with glutenins, are important for the bread-making quality of wheat. They are divided into four subfamilies, the alpha-, beta-, gamma-, and omega-gliadins, depending on their electrophoresis pattern, chromosomal location, and DNA and protein structures. Using a PCR-based strategy we isolated and sequenced an omega-gliadin sequence. We also determined the chromosomal subarm location of this sequence using wheat aneuploids and deletion lines. The gene is 1858 bp long and contains a coding sequence 1248 bp in length. Like all other gliadin gene families characterized in cereals, the omega-gliadin gene described here had characteristic features including two repeated sequences 300 bp upstream of the start codon. At the DNA level, the gene had a high degree of similarity to the omega-secalin and C-hordein genes of rye and barley, but exhibited much less homology to the alpha- and beta-gliadin gene families. In terms of the deduced amino acid sequence, this gene has about 80 and 70% similarity to the omega-secalin and C-hordein genes, respectively, and possesses all the features reported for other gliadin gene families. The omega-gliadin gene has about 30 repeats of the core consensus sequences PQQPX and XQQPQQX, twice as many as other gliadin gene families. Southern blotting and PCR analysis with aneuploid and deletion lines for the short arm of chromosome 1A showed that the omega-gliadin was located on the distal 25% of the short arm of chromosome 1A. By comparison of PCR and A-PAGE profiles for deletion stocks, its genomic location must be at a different locus from gli-Ala in 'Chinese Spring'.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».