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Enregistrement W2160737442 · doi:10.1039/b310767a

Probing the stereochemistry of the active site of gamma-glutamyl transpeptidase using sulfur derivatives of l-glutamic acid

2004· article· en· W2160737442 sur OpenAlexafffund
Christian Lherbet, Jeffrey W. Keillor

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSulfur Compounds in Biology
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de Montréal
Mots-clésChemistryStereospecificityDiastereomerSulfoxideStereochemistryMethionine sulfoxideMoietyMethionineAmino acidOrganic chemistryBiochemistryCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gamma-glutamyl transpeptidase (GGT) catalyses the transfer of a gamma-glutamyl moiety from a donor substrate to different acceptors, such as amino acids and water. GGT is known to display relatively low stereospecificity with respect to the alpha-stereocentre of its donor substrates. In this study we have studied its stereospecificity with respect to the stereocentre at the delta-position of different analogues of L-glutamic acid. Notably, L-methionine sulfoxide is well-recognised whereas L-methionine sulfone and L-methionine sulfoximine are not. Furthermore, when the synthetic gamma-diastereoisomers of L-methionine sulfoxide were separated and tested, it was discovered that GGT shows remarkable stereospecificity at the gamma-position, binding the S(C)S(S) diastereoisomer with a K(i) of 3.5 mM, whereas the S(C)R(S) diastereoisomer is not recognised. Finally, using a sulfoxide as a new pharmacophore for GGT, we have synthesized and tested an analogue of glutathione to obtain a very promising competitive inhibitor with a K(i) of (53 +/- 3) microM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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