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Enregistrement W2160757514 · doi:10.1128/aem.00696-07

Phylogenetic Analysis of Deformed Wing Virus Genotypes from Diverse Geographic Origins Indicates Recent Global Distribution of the Virus

2007· article· en· W2160757514 sur OpenAlex
Olga Berényi, Tamás Bakonyi, Irmgard Derakhshifar, Hemma Köglberger, G. Topolska, W. Ritter, Hermann Pechhacker, Norbert Nowotny

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHungarian Scientific Research Fund
Mots-clésPhylogenetic treeBiologyDeformed wing virusGeneticsPhylogeneticsGenomeVirusGeneVarroa destructorZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Honeybees originating from 10 different countries (Austria, Poland, Germany, Hungary, Slovenia, Nepal, Sri Lanka, the United Arab Emirates, Canada, and New Zealand) located on four continents were analyzed for the presence of deformed wing virus (DWV) nucleic acid by reverse transcription-PCR. Two target regions within the DWV genome were selected for PCR amplification and subsequent sequencing, i.e., a region within the putative VP2 and VP4 structural-protein genes and a region within the RNA helicase enzyme gene. DWV nucleic acid was amplified from 34 honeybee samples representing all the above-mentioned countries with the notable exception of New Zealand. The amplification products were sequenced, and phylogenetic analyses of both genomic regions were performed independently. The phylogenetic analyses included all sequences determined in this study as well as previously published DWV sequences and the sequences of two closely related viruses, Kakugo virus (KGV) and Varroa destructor virus 1 (VDV-1). In the sequenced regions, the DWV genome turned out to be highly conserved, independent of the geographic origins of the honeybee samples: the partial sequences exhibited 98 to 99% nucleotide sequence identity. Substitutions were most frequently observed at the same positions in the various DWV sequences. Due to the high level of sequence conservation, no significant clustering of the samples in the phylogenetic trees could be identified. On the other hand, the phylogenetic analyses support a genetic segregation of KGV and VDV-1 from DWV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,626
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle