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Enregistrement W2160777008 · doi:10.1002/pros.10076

Identification of single nucleotide polymorphisms in the human kallikrein 10 (<i>KLK10</i>) gene and their association with prostate, breast, testicular, and ovarian cancers

2002· article· en· W2160777008 sur OpenAlex
Bhupinder B. Bharaj, Liu‐Ying Luo, Klaus Jung, Carsten Stephan, Eleftherios P. Diamandis

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Prostate · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyExonProstate cancerGermline mutationCancer researchBreast cancerSingle-nucleotide polymorphismGeneGeneticsCancerGenotypeMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The KLK10 gene (also known as the normal epithelial cell-specific 1 gene) is a member of the expanded human kallikrein gene family. Recently, it has been reported that KLK10 is a tumor suppressor gene and that its expression is downregulated in various forms of cancer and cancer cell lines. KLK10 is also upregulated in ovarian cancer. We thus hypothesized that the KLK10 gene may be a target for mutations in various cancers. METHODS: We sequenced the five coding exons of the KLK10 gene using genomic DNA from various tumors, normal tissues, and blood, by PCR amplification and automated sequencing. RESULTS: In none of the tumor-derived DNAs, we identified somatic mutations that could inactivate this gene. However, we identified a prevalent germline single nucleotide variation at codon 50 (exon 3) of this gene [GCC (alanine) to TCC (serine)]. The GCC genotype was less prevalent in prostatic cancer patients in comparison to control subjects (P = 0.027) but no differences were seen with testicular, ovarian, and breast cancer. We also identified four genetic variations in exon 4, at codons106 [GGC (glycine) to GGA (glycine)], codon 112 [ACG (threonine) to ACC (threonine)], codon 141 [CTA (leucine) to CTG (leucine)], and at codon 149 [CCG (proline) to CTG (leucine)]. None of these variations was significantly different between normal subjects and cancer groups. CONCLUSIONS: We found no evidence for somatic mutations of the KLK10 gene in cancers of the prostate, breast, ovary, and testis. The single nucleotide variation at codon 50 appears to be associated with prostate cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,499
Score d'incertitude au seuil0,356

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle