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Enregistrement W2160793650 · doi:10.1111/j.1542-4758.2012.00759.x

<i><scp>S</scp>taphylococcus aureus</i> nasal carriage in a <scp>M</scp>oroccan dialysis center and isolates characterization

2012· article· en· W2160793650 sur OpenAlexvenueno aff
Bouchra Oumokhtar, Mohamed Elazhari, Mohammed Timinouni, Karima Bendahhou, B. Bennani, Mustapha Mahmoud, Abelhakim El Ouali Lalami, Sanae Berrada, Mohammed Arrayhani, Tariq Squalli Houssaini

Notice bibliographique

RevueHemodialysis International · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésStaphylococcus aureusCarriageMedicineMicrobiologyHemodialysisAnterior naresVirulenceAntibiotic resistanceSCCmecPenicillinAntibioticsMethicillin-resistant Staphylococcus aureusInternal medicineBiologyGeneBacteriaPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus, which has its ecological niche in the anterior nares, has been shown to cause a variety of infectious diseases mainly for patients in hemodialysis units. We performed this study to evaluate the prevalence of nasal S. aureus carriage among hemodialysis outpatients, to determine the antimicrobial susceptibility of isolates, to characterize the virulence genes, and to identify associated risk factors. Nares swab specimens were obtained from 70 outpatients on hemodialysis between March and June 2010. Samples were plated immediately onto S. aureus specific media and pattern of antibacterial sensitivity was determined using disk diffusion method. Polymerase chain reaction was used to detect nuc, mecA, and genes encoding staphylococcal toxins. Medical record of patients was explored to determine S.aureus carriage risk factors. Nasal screening identified 42.9% S. aureus carriers with only one (3.3%) methicillin-resistant S. aureus isolate. Among the methicillin-susceptible S. aureus isolates, high rate of penicillin resistance (81.8%) has been detected. The identified risk factors were male gender and age ≤ 30 years. Research of virulence factors showed a high genetic diversity among the 30 S. aureus isolates. Twenty-one (70%) of them had at least one virulence gene, of which 3.3% were Panton-Valentine leukocidin (lukS/F-PV) genes. S. aureus carriage must be screened for at regular intervals in hemodialysis patients. Setting up a bacterial surveillance system is one of the strategies to understand the epidemiology of methicillin-resistant S. aureus, to guide local antibiotic policy and prevent spread of antibiotic-resistant S. aureus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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