Identification of six new <i>Alternaria</i> sulfoconjugated metabolites by high‐resolution neutral loss filtering
Notice bibliographique
Résumé
RATIONALE: Many species of Alternaria damage important agricultural crops, including small grains and tomatoes. These fungi can produce a variety of secondary metabolites, some of which are toxic to humans and animals. Interest in screening for conjugated or 'modified' mycotoxins has increased because of their tendency to evade traditional analytical screening methods. Two sulfoconjugated Alternaria toxins have been reported and the potential exists for many more. METHODS: One hundred and forty-eight Canadian strains of Alternaria spp., about half of them isolated from grain, were grown on Potato Dextrose Agar in Petri dishes for 7 days. Plugs of each strain were removed, extracted and screened by a rapid liquid chromatography (LC)/data-dependent tandem mass spectrometry (MS(2)) method in negative electrospray ionization mode. Data generated on an Orbitrap Q-Exactive mass spectrometer was processed by post-acquisition neutral loss filtering (NLF). Seven isolates that produced sulfoconjugates of known Alternaria toxins were selected for growth on three additional types of fermentation media. RESULTS: Collision-induced dissociation of sulfoconjugated ions displayed a distinctive neutral loss of SO3 (79.957 Da) that was detected in the MS(2) datasets using post-acquisition NLF. A total of 108 of the 148 isolates screened produced sulfoconjugated metabolites on agar plates. Analysis of the seven isolates grown in liquid culture, on rice and Cheerios, led to the discovery of six new, two previously reported and 30 unidentified sulfoconjugated compounds. CONCLUSIONS: NLF of HRMS(2) data from an Orbitrap Q-Exactive is a powerful tool for the rapid discovery of sulfoconjugated fungal metabolites. This technique could also be applied to the detection of other important conjugated mycotoxins such as glucosides. The majority of the Canadian isolates of Alternaria spp. studied produced sulfoconjugated metabolites, some of which had no known 'free' Alternaria precursor metabolite, indicating that they are possibly new metabolites. The advantage of sulfoconjugation to Alternaria spp. is unknown, and warrants further study into the mechanisms behind the sulfur assimilatory pathways.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».