Effect of Nitrate and Acetylene on <i>nirS</i> , <i>cnorB</i> , and <i>nosZ</i> Expression and Denitrification Activity in <i>Pseudomonas mandelii</i>
Notice bibliographique
Résumé
Nitrate acts as an electron acceptor in the denitrification process. The effect of nitrate in the range of 0 to 1,000 mg/liter on Pseudomonas mandelii nirS, cnorB, and nosZ gene expression was studied, using quantitative reverse transcription-quantitative PCR. Denitrification activity was measured by using the acetylene blockage method and gas chromatography. The effect of acetylene on gene expression was assessed by comparing denitrification gene expression in P. mandelii culture grown in the presence or absence of acetylene. The higher the amount of NO(3)(-) present, the greater the induction and the longer the denitrification genes remained expressed. nirS gene expression reached a maximum at 2, 4, 4, and 6 h in cultures grown in the presence of 0, 10, 100, and 1,000 mg of KNO(3)/liter, respectively, while induction of nirS gene ranged from 12- to 225-fold compared to time zero. cnorB gene expression also followed a similar trend. nosZ gene expression did not respond to NO(3)(-) treatment under the conditions tested. Acetylene decreased nosZ gene expression but did not affect nirS or cnorB gene expression. These results showed that nirS and cnorB responded to nitrate concentrations; however, significant denitrification activity was only observed in culture with 1,000 mg of KNO(3)/liter, indicating that there was no relationship between gene expression and denitrification activity under the conditions tested.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».