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Enregistrement W2160943886 · doi:10.1128/aem.00080-09

Effect of pH and Temperature on Denitrification Gene Expression and Activity in <i>Pseudomonas mandelii</i>

2009· article· en· W2160943886 sur OpenAlexafffund
Saleema Saleh-Lakha, Kelly Shannon, Sherri L. Henderson, Claudia Goyer, J. T. Trevors, Bernie J. Zebarth, David L. Burton

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWastewater Treatment and Nitrogen Removal
Établissements canadiensUniversity of GuelphNova Scotia Department of AgricultureAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Innovation Trust
Mots-clésDenitrificationGene expressionChemistryNitrous oxideMolecular biologyGeneBiochemistryBiologyNitrogenOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas mandelii liquid cultures were studied to determine the effect of pH and temperature on denitrification gene expression, which was quantified by quantitative reverse transcription-PCR. Denitrification was measured by the accumulation of nitrous oxide (N(2)O) in the headspace in the presence of acetylene. Levels of gene expression of nirS and cnorB at pH 5 were 539-fold and 6,190-fold lower, respectively, than the levels of gene expression for cells grown at pH 6, 7, and 8 between 4 h and 8 h. Cumulative denitrification levels were 28 micromol, 63 micromol, and 22 micromol at pH 6, 7, and 8, respectively, at 8 h, whereas negligible denitrification was measured at pH 5. P. mandelii cells grown at 20 degrees C and 30 degrees C exhibited 9-fold and 94-fold increases in levels of cnorB expression between 0 h and 2 h, respectively, and an average 17-fold increase in levels of nirS gene expression. In contrast, induction of cnorB and nirS gene expression for P. mandelii cells grown at 10 degrees C did not occur in the first 4 h. Levels of cumulative denitrification at 10 h were 6.6 micromol for P. mandelii cells grown at 10 degrees C and 20 degrees C and 30 micromol for cells grown at 30 degrees C. Overall, levels of cnorB and nirS expression were relatively insensitive to pH values over the range of pH 6 to 8 but were substantially reduced at pH 5, whereas gene expression was sensitive to temperature, with induction and time to achieve maximum gene expression delayed as the temperature decreased from 30 degrees C. Low pH and temperature negatively affected denitrification activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,085
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations198
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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