HDAC-regulated myomiRs control BAF60 variant exchange and direct the functional phenotype of fibro-adipogenic progenitors in dystrophic muscles
Notice bibliographique
Résumé
Fibro-adipogenic progenitors (FAPs) are important components of the skeletal muscle regenerative environment. Whether FAPs support muscle regeneration or promote fibro-adipogenic degeneration is emerging as a key determinant in the pathogenesis of muscular diseases, including Duchenne muscular dystrophy (DMD). However, the molecular mechanism that controls FAP lineage commitment and activity is currently unknown. We show here that an HDAC-myomiR-BAF60 variant network regulates the fate of FAPs in dystrophic muscles of mdx mice. Combinatorial analysis of gene expression microarray, genome-wide chromatin remodeling by nuclease accessibility (NA) combined with next-generation sequencing (NA-seq), small RNA sequencing (RNA-seq), and microRNA (miR) high-throughput screening (HTS) against SWI/SNF BAF60 variants revealed that HDAC inhibitors (HDACis) derepress a "latent" myogenic program in FAPs from dystrophic muscles at early stages of disease. Specifically, HDAC inhibition induces two core components of the myogenic transcriptional machinery, MYOD and BAF60C, and up-regulates the myogenic miRs (myomiRs) (miR-1.2, miR-133, and miR-206), which target the alternative BAF60 variants BAF60A and BAF60B, ultimately directing promyogenic differentiation while suppressing the fibro-adipogenic phenotype. In contrast, FAPs from late stage dystrophic muscles are resistant to HDACi-induced chromatin remodeling at myogenic loci and fail to activate the promyogenic phenotype. These results reveal a previously unappreciated disease stage-specific bipotency of mesenchimal cells within the regenerative environment of dystrophic muscles. Resolution of such bipotency by epigenetic intervention with HDACis provides a molecular rationale for the in situ reprogramming of target cells to promote therapeutic regeneration of dystrophic muscles.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».