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Enregistrement W2160945753 · doi:10.1152/ajpregu.00152.2004

Mitochondrial enzyme content in the muscles of high-performance fish: evolution and variation among fiber types

2004· article· en· W2160945753 sur OpenAlexaff
Anne C. Dalziel, Shannon E. Moore, Christopher D. Moyes

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMitochondrial DNACitrate synthaseMuscle fibreGeneGC-contentNuclear DNAMitochondrionMessenger RNAZoologyBiochemistryEnzymeAnatomyGenomeSkeletal muscle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Muscle mitochondrial content varies widely among fiber types and species. We investigated the origins of variation in the activity of the mitochondrial enzyme citrate synthase (CS), an index of mitochondrial abundance, among fiber types and species of high-performance fish (tunas and billfishes). CS activities varied up to 30-fold among muscles: lowest in billfish white muscle and highest in billfish heater organ. Among species, CS activities of red, white, and cardiac muscles of three tuna species were twofold greater than the homologous muscles of two billfish species. Because comparisons of CS amino acid sequences deduced from a combination of PCR methods argue against clade-specific differences in catalytic properties, CS activity reflects CS content among these five species. To assess the bases of these differences in CS activity, we looked at the relationship between CS activity (U/g muscle), nuclear content (DNA/g muscle), and CS transcript levels (CS mRNA/g RNA). Muscle CS activity differed by 10- to 30-fold when expressed per gram of muscle but only threefold when expressed per milligram of DNA. Thus it is nuclear DNA content, not fiber-type differences, in CS gene expression that may be the main determinant of CS activity in muscle. Conversely, evolutionary (tunas vs. billfishes) differences in CS arise from differences in posttranscriptional regulation, based on relationships between CS enzyme levels and CS mRNA assessed by quantitative competitive RT-PCR. These data argue that fiber-type differences can arise without major differences in fiber-type-specific regulation of the CS gene, whereas evolutionary differences may be largely due to posttranscriptional regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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