Quantification of donor microchimerism in sex-mismatched porcine allotransplantation by competitive PCR
Notice bibliographique
Résumé
The persistence of donor cells in recipient circulation and peripheral tissues post-transplantation has been demonstrated in solid organ allotransplantation and xenotransplantation models. Although this state of microchimerism has been postulated as the basis for graft acceptance, chimerism has not been directly linked to the maintenance of peripheral tolerance or prevention of rejection. Studies have demonstrated that the qualitative presence or absence of donor microchimerism bears no association with graft acceptance. Our preliminary work suggests that there is a threshold chimerism necessary for the induction of donor-specific hyporesponsiveness. Because the kinetics of donor cell accumulation and distribution in allograft recipients are largely unknown, quantitative analyses are needed to evaluate chimerism's significance to donor-specific tolerance. We developed a quantitative, competitive PCR assay to precisely measure the amount of chimerism in male to female transplant pairs by targeting the sex-determining region of the Y chromosome (SRY gene). Traditionally, this technique requires that serial known amounts of an SRY-specific competitive template (CT) be coamplified with a constant amount of sample DNA to determine the equivalence point of the relative band intensities of the PCR products. However running a panel of PCRs with CT amounts above and below the equivalence point to generate a standard curve for ever' sample is laborious. Here we describe the generation of a single standard curve that permits the rapid and reliable quantification of microchimerism after coamplification of sample DNA with a single amount of CT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».