Phase Variation in H Type I and Lewis a Epitopes of <i>Helicobacter pylori</i> Lipopolysaccharide
Notice bibliographique
Résumé
Helicobacter pylori NCTC 11637 lipopolysaccharide (LPS) expresses the human blood group antigens Lewis x (Le(x)), Le(y), and H type I. In this report, we demonstrate that the H type I epitope displays high-frequency phase variation. One variant expressed Le(x) and Le(y) and no H type I as determined by serology; this switch was reversible. Insertional mutagenesis in NCTC 11637 of JHP563 (a poly(C) tract containing an open reading frame homologous to glycosyltransferases) yielded a transformant with a serotype similar to the phase variant. Structural analysis of the NCTC 11637 LPS confirmed the loss of the H type I epitope. Sequencing of JHP563 in strains NCTC 11637, an H type I-negative variant, and an H type I-positive switchback variant showed a C14 (gene on), C13 (gene off), and C14 tract, respectively. Inactivation of strain G27, which expresses Le(x), Le(y), H type I, and Le(a), yielded a transformant that expressed Le(x) and Le(y). We conclude that JHP563 encodes a beta3-galactosyltransferase involved in the biosynthesis of H type I and Le(a) and that phase variation in H type I is due to C-tract changes in this gene. A second H type I-negative variant (variant 3a) expressed Le(x) and Le(a) and had lost both H type I and Le(y) expression. Inactivation of HP093-HP094 resulted in a transformant expressing Le(x) and lacking Le(y) and H type I. Structural analysis of a mutant LPS confirmed the serological data. We conclude that the HP093-HP094 alpha2-fucosyltransferase (alpha2-FucT) gene product is involved in the biosynthesis of both Le(y) and Le(x). Finally, we inactivated HP0379 in strain 3a. The transformant had lost both Le(x) and Le(a) expression, which demonstrates that the HP0379 gene product is both an alpha3- and an alpha4-FucT. Our data provide understanding at the molecular level of how H. pylori is able to diversify in the host, a requirement likely essential for successful colonization and transmission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».