MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2161131703 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0776

A Systematic Approach to Analysing Gene-Gene Interactions: Polymorphisms at the Microsomal Epoxide Hydrolase <i>EPHX</i> and Glutathione <i>S</i>-transferase <i>GSTM1, GSTT1</i>, and <i>GSTP1</i> Loci and Breast Cancer Risk

2007· article· en· W2161131703 sur OpenAlex
Amanda B. Spurdle, Jiun‐Horng Chang, Graham Byrnes, Gillian S. Dite, Margaret McCredie, Graham G. Giles, Melissa C. Southey, Georgia Chenevix‐Trench, John L. Hopper

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCancer Care OntarioNational Health and Medical Research CouncilNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthHuntsman Cancer InstituteMedical Research Council
Mots-clésGSTP1GenotypeMicrosomal epoxide hydrolaseOdds ratioConfidence intervalConfoundingLogistic regressionGeneticsBiologyGlutathione S-transferasePopulationOncologyInternal medicineGeneBioinformaticsMedicineGlutathioneEpoxide hydrolaseEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: We undertook a case-control study in an Australian Caucasian population-based sample of 1,246 cases and 664 controls to assess the roles of detoxification gene polymorphisms EPHX T>C Tyr(113)His, GSTT1 deletion, GSTM1 deletion, and GSTP1 A>G Ile(105)Val on risk of breast cancer. METHODS: We systematically addressed the main effects and possible gene-gene interactions using unconditional logistic regression to estimate odds ratios (OR) adjusted for potential confounders and using standard model building approaches based on likelihood theory. RESULTS: There was a decreased risk associated with the EPHX CC genotype [OR, 0.60; 95% confidence interval (95% CI), 0.43-0.84; P = 0.003], marginally significant evidence of increased risk with GSTM1 null genotype (OR, 1.21; 95% CI, 1.00-1.47; P = 0.05), but no association with GSTT1 null genotype (OR, 1.12; 95% CI, 0.86-1.45; P = 0.4) or GSTP1 (OR, 0.95; 95% CI, 0.82-1.10; P = 0.5) genotype. The full model with all interactions gave a significantly better fit than a main-effects-only model (P < 0.001), providing evidence for gene-gene interactions. The most parsimonious model included main effects for EPHX, GSTT1, and GSTM1; a two-way interaction between EPHX and GSTM1; and a three-way interaction between EPHX, GSTM1, and GSTT1. Predicted risks were greatest for women carrying deletions of both GSTT1 and GSTM1, with either the EPHX TC genotype (OR, 2.02; 95% CI, 1.19-3.45; P = 0.009) or EPHX CC genotype (OR, 3.54; 95% CI, 1.29-9.72; P = 0.14). CONCLUSION: Detoxification gene polymorphisms may interact with each other to result in small groups of individuals at modestly increased risk. We caution against overinterpretation and suggest that pooling of similarly large studies is needed to clarify the possible role of such complex gene-gene interactions on breast cancer risk. 2007;16(4):769-74).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,354
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle