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Enregistrement W2161140483 · doi:10.1186/s12974-015-0352-2

Evidence for the involvement of gamma delta T cells in the immune response in Rasmussen encephalitis

2015· article· en· W2161140483 sur OpenAlexfundno aff
Geoffrey C. Owens, Kate L. Erickson, Colin C. Malone, Calvin Pan, My N. Huynh, Julia W. Chang, Thabiso W. Chirwa, Harry V. Vinters, Gary W. Mathern, Carol A. Kruse

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroinflammation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Colorado School of Medicine, Anschutz Medical CampusNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteCollege of Medicine, University of OklahomaNational Institutes of HealthUniversidade de São PauloUniversity of AlbertaFeinberg School of MedicineChildren's National HospitalJohns Hopkins UniversityUniversity of OklahomaSchool of Medicine, Stanford UniversityNorthwestern University
Mots-clésT-cell receptorCD8Immune systemT cellCD3PathologyPeripheral blood mononuclear cellBiologyMolecular biologyImmunologyEncephalitisMedicineGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Rasmussen encephalitis (RE) is a rare neuroinflammatory disease characterized by intractable seizures and progressive atrophy on one side of the cerebrum. Perivascular cuffing and clusters of T cells in the affected cortical hemisphere are indicative of an active cellular immune response. METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and brain-infiltrating lymphocytes (BILs) were isolated from 20 RE surgery specimens by standard methods, and CD3(+) T cell populations were analyzed by flow cytometry. Gamma delta T cell receptor spectratyping was carried out by nested PCR of reversed transcribed RNA extracted from RE brain tissue, followed by high resolution capillary electrophoresis. A MiSeq DNA sequencing platform was used to sequence the third complementarity determining region (CDR3) of δ1 chains. RESULTS: CD3(+) BILs from all of the RE brain specimens comprised both αβ and γδ T cells. The median αβ:γδ ratio was 1.9 (range 0.58-5.2) compared with a median ratio of 7.7 (range 2.7-40.8) in peripheral blood from the same patients. The αβ T cells isolated from brain tissue were predominantly CD8(+), and the majority of γδ T cells were CD4(-) CD8(-). Staining for the early activation marker CD69 showed that a fraction of the αβ and γδ T cells in the BILs were activated (median 42%; range 13-91%, and median 47%; range 14-99%, respectively). Spectratyping T cell receptor (TCR) Vδ1-3 chains from 14 of the RE brain tissue specimens indicated that the γδ T cell repertoire was relatively restricted. Sequencing δ1 chain PCR fragments revealed that the same prevalent CDR3 sequences were found in all of the brain specimens. These CDR3 sequences were also detected in brain tissue from 15 focal cortical dysplasia (FCD) cases. CONCLUSION: Neuroinflammation in RE involves both activated αβ and γδ T cells. The presence of γδ T cells with identical TCR δ1 chain CDR3 sequences in all of the brain specimens examined suggests that a non-major histocompatibility complex (MHC)-restricted immune response to the same antigen(s) is involved in the etiology of RE. The presence of the same δ1 clones in CD brain implies the involvement of a common inflammatory pathway in both diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,792
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,139
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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