Real‐time fluorescence‐based detection of furanocoumarin photoadducts of DNA
Notice bibliographique
Résumé
Real-time fluorescence detection systems were adapted to identify DNA adducts formed by photogenotoxic phytochemicals. Two assays were developed: the first was based on quantitative polymerase chain reaction (qPCR) while the second used thermal denaturation and renaturation (D-R). Both assays employed yeast DNA, the fluorescent dye SYBR Green and a real-time PCR thermocycler. The furanocoumarins 8-methoxypsoralen (8-MOP), 5-methoxypsoralen (5-MOP), psoralen, angelicin and imperatorin, and the furanochrome khellin, were tested for adduct forming ability with up to 2 h of UVA light exposure (lambda = 320-400 nm). The known bifunctional compounds, 8-MOP, 5-MOP and psoralen, were inferred to form biadducts here based on both D-R and qPCR assays, as expected from previous research. The known monofunctional compound angelicin was used as a negative control and did not form biadducts based on either assay. Two compounds of unknown functional specificity, imperatorin and khellin, were determined to be positive and negative for biadduct activity, respectively. Detection of biadducts with 8-MOP, 5-MOP, psoralen and imperatorin, but not angelicin or khellin, was further verified by temperature gradient gel electrophoresis. The fluorescence methods improve and expand upon existing assays to monitor DNA adducts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».