Importance of the αC-helix in the cyclic nucleotide binding domain for the stable channel regulation and function of cyclic nucleotide gated ion channels in Arabidopsis
Notice bibliographique
Résumé
The involvement of cyclic nucleotide gated ion channels (CNGCs) in the signal transduction of animal light and odorant perception is well documented. Although plant CNGCs have recently been revealed to mediate multiple stress responses and developmental pathways, studies that aim to elucidate their structural and regulatory properties are still very much in their infancy. The structure-function relationship of plant CNGCs was investigated here by using the chimeric Arabidopsis AtCNGC11/12 gene that induces multiple defence responses in the Arabidopsis mutant constitutive expresser of PR genes 22 (cpr22) for the identification of functionally essential residues. A genetic screen for mutants that suppress cpr22-conferred phenotypes identified over 20 novel mutant alleles in AtCNGC11/12. One of these mutants, suppressor S58 possesses a single amino acid substitution, arginine 557 to cysteine, in the alphaC-helix of the cyclic nucleotide-binding domain (CNBD). The suppressor S58 lost all cpr22 related phenotypes, such as spontaneous cell death formation under ambient temperature conditions. However, these phenotypes were recovered at 16 degrees C suggesting that the stability of channel function is affected by temperature. In silico modelling and site-directed mutagenesis analyses suggest that arginine 557 in the alphaC-helix of the CNBD is important for channel regulation, but not for basic function. Furthermore, another suppressor mutant, S136 that lacks the entire alphaC-helix due to a premature stop codon, lost channel function completely. Our data presented here indicate that the alphaC-helix is functionally important in plant CNGCs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».