An Extended Domain of <i>Kcnq1ot1</i> Silencing Revealed by an Imprinted Fluorescent Reporter
Notice bibliographique
Résumé
The distal region of mouse chromosome 7 contains two imprinted domains separated by a relatively gene-poor interval. We have previously described a transgenic mouse line called Tel7KI, which contains a green fluorescent protein (GFP) reporter inserted 2.6 kb upstream of the Ins2 gene at the proximal end of this interval. The GFP reporter from Tel7KI is imprinted and maternally expressed in postimplantation embryos. Here, we present evidence that the distal imprinting center, KvDMR1 (IC2), is responsible for the paternal silencing of Tel7KI. First, we show that Tel7KI is silenced when the noncoding RNA Kcnq1ot1 is biallelically expressed due to absence of maternal DNA methylation at IC2. Second, we use an embryonic stem (ES) cell differentiation assay to examine the effect of an IC2 deletion in cis to Tel7KI and show that it impairs the ability of the paternal transmission Tel7KI ES cells to silence GFP. These results suggested that Kcnq1ot1 silencing extends nearly 300 kb further than previously reported and led us to examine other transcripts between IC1 and IC2. We found that splice variants of Th and Ins2 are imprinted, maternally expressed, and regulated by IC2, showing that the silencing domain uncovered by our transgenic line also affects endogenous transcripts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».