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Enregistrement W2161352788 · doi:10.1139/g10-117

Genetic control and identification of QTLs associated with visual quality traits of field pea (<i>Pisum sativum</i> L.)

2011· article· en· W2161352788 sur OpenAlexafffundvenueabout
Lasantha Ubayasena, Kirstin E. Bett, Bunyamin Tar’an, Thomas D. Warkentin

Notice bibliographique

RevueGenome · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSaskatchewan Pulse GrowersMinistry of Agriculture - SaskatchewanUniversity of Saskatchewan
Mots-clésSativumBiologyField peaQuantitative trait locusPisumPopulationTransgressive segregationAmplified fragment length polymorphismCropHorticultureInbred strainCoatAgronomyBotanyGeneticsGenetic diversityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Visual quality of field pea (Pisum sativum L.) is one of the most important determinants of the market value of the harvested crop. Seed coat color, seed shape, and seed dimpling are the major components of visual seed quality of field pea and are considered as important breeding objectives. The objectives of this research were to study the genetics and to identify quantitative trait loci (QTLs) associated with seed coat color, seed shape, and seed dimpling of green and yellow field peas. Two recombinant inbred line populations (RILs) consisting of 120 and 90 lines of F(5)-derived F(7) (F(5:7)) yellow pea (P. sativum 'Alfetta' × P. sativum 'CDC Bronco') and green pea (P. sativum 'Orb' × P. sativum 'CDC Striker'), respectively, were evaluated over two years at two locations in Saskatchewan, Canada. Quantitative inheritance with polygenic control and transgressive segregation were observed for all visual quality traits studied. All 90 RILs of the green pea population and 92 selected RILs from the yellow pea population were screened using AFLP and SSR markers and two linkage maps were developed. Nine QTLs controlling yellow seed lightness, 3 for yellow seed greenness, 15 for seed shape, and 9 for seed dimpling were detected. Among them, five QTLs located on LG II, LG IV, and LG VII were consistent in at least two environments. The QTLs and their associated markers will be useful tools to assist pea breeding programs attempting to pyramid positive alleles for the traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,845
Score d'incertitude au seuil0,102

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2011
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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