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Enregistrement W2161371255 · doi:10.1002/jbt.20313

Global changes in gene regulation demonstrate that unconjugated bilirubin is able to upregulate and activate select components of the endoplasmic reticulum stress response pathway

2010· article· en· W2161371255 sur OpenAlex
Garth H. Oakes, John R. Bend

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biochemical and Molecular Toxicology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Health and Biochemistry
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUnfolded protein responseEndoplasmic reticulumDownregulation and upregulationATF6Endoplasmic-reticulum-associated protein degradationChemistryMicroarray analysis techniquesCell biologyApoptosisGeneGene expressionCaspase 12Molecular biologyBiologyBiochemistryProgrammed cell deathCaspase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated concentrations of unconjugated bilirubin (UCB) are responsible for neonatal jaundice and can eventually lead to kernicterus or death. The molecular mechanism of UCB toxicity is incompletely elucidated. The purpose of this study was to analyze changes in gene regulation mediated by UCB to determine novel pathways that contribute to UCB-mediated toxicity. We employed microarray analysis to determine changes in gene regulation mediated by UCB at both pro- (50 microM) and antioxidant (70 nM) concentrations in Hepa 1c1c7 cells at 1 and 6 h. The changes observed in select genes were validated with qPCR. Using immunoblot analysis, we validated these changes at the protein level for select genes and documented the activation of two proteins involved in the endoplasmic reticulum (ER) stress pathway, eIF2 alpha and PERK. Following treatment with 50 microM UCB, microarray analysis revealed the upregulation of many genes involved in ER stress (ATF3, BiP, CHOP, Dnajb1, and Herp). We demonstrate that upregulation of the proapoptotic transcription factor CHOP results in increased intracellular protein content. It was determined that activation of proteins involved in ER stress was an early event in UCB toxicity as eIF2 alpha and PERK were both phosphorylated and activated by 1 h posttreatment. We also demonstrate that procaspase-12 content, a proposed initiator caspase in ER stress-mediated apoptosis, is decreased by 4 h posttreatment. In conclusion, this study demonstrates that elevated concentrations of UCB (50 microM) are able to activate select components of the ER stress pathway in Hepa 1c1c7 cells, which may contribute to UCB-mediated apoptosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,362

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle