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Enregistrement W2161596891 · doi:10.1897/09-032.1

Challenges in current adult fish laboratory reproductive tests: Suggestions for refinement using a mummichog (<i>Fundulus heteroclitus</i>) case study

2009· article· en· W2161596891 sur OpenAlexaff
Thus Bosker, Kelly R. Munkittrick, Deborah L. MacLatchy

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFundulusReplicateBiologyStatisticsFish <Actinopterygii>PopulationSample (material)Variance (accounting)Reproductive successSample size determinationToxicologyEcologyFisheryDemographyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Concerns about screening endocrine-active contaminants have led to the development of a number of short-term fish reproductive tests. A review conducted of 62 published adult fish reproductive papers using various fish species found low samples sizes (mean of 5.7 replicates with a median of 5 replicates) and high variance (an average coefficient of variance of 43.8%). The high variances and low sample sizes allow only relatively large differences to be detected with the current protocols; the average significant difference detected was a 68.7% reduction in egg production, while only differences above 50% were detected with confidence. This result indicates low power to detect more subtle differences and a high probability of type II errors in interpretation. The present study identifies several ways to increase the power of the adult fish reproductive test in the mummichog (Fundulus heteroclitus). By identifying the peak timing of egg production (before and after the new moon), extending the duration of the experiment (increased from 7 to 14 d), and determining that a sample size of eight replicate tanks per treatment accurately predicts variance in the sample population (based on pre-exposure variation calculations of replicate tanks), the power of the test has been significantly increased. The present study demonstrates that weaknesses in the current adult fish reproductive tests can easily be addressed by focusing on improved understanding of the reproductive behavior of the test species and developing study designs that include calculating desired variability levels and increasing replicates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,121
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,094
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1210,094
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0060,002
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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