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Enregistrement W2161740787 · doi:10.1021/ac5010212

Simple Capillary Electrophoresis–Mass Spectrometry Method for Complex Glycan Analysis Using a Flow-Through Microvial Interface

2014· article· en· W2161740787 sur OpenAlexafffund
Roxana Jayo, Morten Thaysen‐Andersen, Petrus W. Lindenburg, Rob Haselberg, Thomas Hankemeier, Rawi Ramautar, David D. Y. Chen

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Capillary Electrophoresis Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryGlycanCapillary electrophoresisChromatographyMass spectrometryGlycosylationDerivatizationChinese hamster ovary cellBiochemistryGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A flow-through microvial is used to interface capillary electrophoresis and mass spectrometry (CE-MS) to develop a method for simultaneous profiling both neutral and sialylated glycans without derivatization or labeling. The CE separation was performed at near-zero electroosmotic flow in a capillary with neutral, hydrophilic coating, using 50 mM ammonium acetate in 20% methanol (pH 3.1) as the background electrolyte. The method was optimized with reversed CE polarity and negative ion ESI-MS. Enzymatically released N-glycans from human immunoglobulin G (IgG) were used as the test sample. The approach was also used to study the more complex N-glycans from recombinant human erythropoietin (rHuEPO) expressed in Chinese hamster ovary (CHO) cells. Glycoscreening of rHuEPO was performed using a triple quadrupole MS and an ultrahigh resolution TOF-MS. The high sensitivity and high mass accuracy of the TOF-MS revealed the presence of more than 70 glycans. Three mono- and di-sialylated tetra-antennary N-glycans and one mono-sialylated tri-antennary N-glycan of rHuEPO are reported for the first time. Further glycan heterogeneity was identified of the highly sialylated N-glycans of rHuEPO by extensive acetylation, Neu5Ac/Neu5Gc variation and the presence of N-acetyl-lactosamine repeats. For comparative purposes, porous graphitic carbon-based LC-MS/MS was also used to glycoprofile rHuEPO. This work demonstrates the potential of CE-MS to provide a comprehensive glycosylation profile with detailed features of the secondary glycan modifications. The CE-MS based method eliminates the need to label the N-glycans, as well as the requirement to desialylate before analysis, and could complement other established techniques for glycan characterization of therapeutic glycoproteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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