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Enregistrement W2161749950

Gene-specific differential response to anti-apoptotic therapies in zebrafish models of ocular coloboma.

2011· article· en· W2161749950 sur OpenAlexaff
Cheryl Y. Gregory‐Evans, Mariya Moosajee, Xianghong Shan, Kevin Gregory‐Evans

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishColobomaBiologyTUNEL assayApoptosisMolecular biologyCell biologyProgrammed cell deathGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: We recently demonstrated that molecular therapy using aminoglycosides can overcome the underlying genetic defect in two zebrafish models of ocular coloboma and showed abnormal cell death to be a key feature associated with the optic fissure closure defects. In further studies to identify molecular therapies for this common congenital malformation, we now examine the effects of anti-apoptotic compounds in zebrafish models of ocular coloboma in vivo. METHODS: Two ocular coloboma zebrafish lines (pax2.1/noi(tu29a) and lamb1/gup(m189)) were exposed to diferuloylmethane (curcumin) or benzyloxycarbonyl-Val-Ala-Asp(Ome)-fluoromethylketone (zVAD-fmk; a pan-caspase inhibitor) for up to 8 days post-fertilization. The effects of these compounds were assessed by morphology, histology, terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling (TUNEL) staining and western blot analysis. RESULTS: The size of the coloboma in gup zebrafish mutants treated with diferuloylmethane was greatly reduced. In treated mutants a reduction in TUNEL staining and a 67% decrease in activated caspase-3 protein were observed. The release of cytochrome c from the mitochondria into the cytosol was reduced fourfold by in vivo diferuloylmethane treatment, suggesting that the drug was acting to inhibit the intrinsic apoptotic pathway. Inhibition of caspases directly with zVAD-fmk also resulted in a similar reduction in coloboma phenotype. Treatment with either diferuloylmethane or zVAD-fmk resulted in a statistically significant 1.4 fold increase in length of survival of these mutant zebrafish (p<0.001), which normally succumb to the lethal genetic mutation. In contrast, the coloboma phenotype in noi zebrafish mutants did not respond to either diferuloylmethane or zVAD-fmk exposure, even though inhibition of apoptotic cell death was observed by a reduction in TUNEL staining. CONCLUSIONS: The differential sensitivity to anti-apoptotic agents in lamb1-deficient and pax2.1-deficient zebrafish models, suggests that apoptotic cell death is not a final common pathway in all ocular coloboma genotypes. When considering anti-cell death therapies for ocular colobomatous defects attention should be paid to the genotype under investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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