Substrate specificity, regioselectivity and cryptoregiochemistry of plant and animal ω-3 fatty acid desaturases
Notice bibliographique
Résumé
In order to define the substrate requirements, regiochemistry and cryptoregiochemistry of the omega-3 fatty acid desaturases involved in polyunsaturated fatty acid formation, the genes Fad3 and fat-1 from Brassica napus and the nematode Caenorhabditis elegans respectively were expressed in baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae). Various fatty acids, including deuterium-labelled thia-fatty acids, were supplied to growing cultures of transformed yeast. The results from GC-MS analysis of the desaturated products indicate that both the plant and animal desaturases act on unsaturated substrates of 16-20 carbons with a preference for omega-6-unsaturated fatty acids. The regioselectivities of both enzymes were confirmed to be that of omega-3 desaturases. The primary deuterium kinetic isotope effects at C-15 and C-16 of a C(18) fatty acid analogue were measured via competitive incubation experiments. Whereas k(H)/k(D) at the omega-3 position was shown to be large, essentially no kinetic isotope effect at the omega-2 position was observed for the plant or the nematode enzymes. These results indicate that omega-3 desaturation is initiated by an energetically difficult C-H bond cleavage at the carbon closer to the carboxyl terminus. These results will be discussed in the context of a general model relating the structure and function of membrane-bound fatty acid desaturases featuring different regioselectivities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».