Antimicrobial Resistance in Urinary Tract Pathogens in Canada from 2007 to 2009: CANWARD Surveillance Study
Notice bibliographique
Résumé
From January 2007 to December 2009, an annual Canadian national surveillance study (CANWARD) tested 2,943 urinary culture pathogens for antimicrobial susceptibilities according to Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines. The most frequently isolated urinary pathogens were as follows (number of isolates, percentage of all isolates): Escherichia coli (1,581, 54%), enterococci (410, 14%), Klebsiella pneumoniae (274, 9%), Proteus mirabilis (122, 4%), Pseudomonas aeruginosa (100, 3%), and Staphylococcus aureus (80, 3%). The rates of susceptibility to trimethoprim-sulfamethoxazole (SXT) were 78, 86, 84, and 93%, respectively, for E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis, and S. aureus. The rates of susceptibility to nitrofurantoin were 96, 97, 33, and 100%, respectively, for E. coli, enterococci, K. pneumoniae, and S. aureus. The rates of susceptibility to ciprofloxacin were 81, 40, 86, 81, 66, and 41%, respectively, for E. coli, enterococci, K. pneumoniae, P. mirabilis, P. aeruginosa, and S. aureus. Statistical analysis of resistance rates (resistant plus intermediate isolates) by year for E. coli over the 3-year study period demonstrated that increased resistance rates occurred only for amoxicillin-clavulanate (from 1.8 to 6.6%; P < 0.001) and for SXT (from 18.6 to 24.3%; P = 0.02). For isolates of E. coli, in a multivariate logistic regression model, hospital location was independently associated with resistance to ciprofloxacin (P = 0.026) with higher rates of resistance observed in inpatient areas (medical, surgical, and intensive care unit wards). Increased age was also associated with resistance to ciprofloxacin (P < 0.001) and with resistance to two or more commonly prescribed oral agents (amoxicillin-clavulanate, ciprofloxacin, nitrofurantoin, and SXT) (P = 0.005). We conclude that frequently prescribed empirical agents for urinary tract infections, such as SXT and ciprofloxacin, demonstrate lowered in vitro susceptibilities when tested against recent clinical isolates.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».