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Enregistrement W2161836652 · doi:10.1093/infdis/jir262

Chemokine (C-C Motif) Receptor 5 −2459 Genotype in Patients Receiving Highly Active Antiretroviral Therapy: Race-Specific Influence on Virologic Success

2011· article· en· W2161836652 sur OpenAlexaff
Rajeev K. Mehlotra, Vinay K. Cheruvu, Melinda J. Blood Zikursh, Rebekah L. Benish, Michael M. Lederman, Robert A. Salata, Barbara Gripshover, Grace A. McComsey, Michelle V. Lisgaris, Scott A. Fulton, Carlos S. Subauste, Richard J. Jurevic, Chantal Guillemette, Peter A. Zimmerman, Benigno Rodríguez

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésGenotypeMedicineChemokineChemokine receptor CCR5SidaVirologyAntiretroviral therapyHuman immunodeficiency virus (HIV)Chemokine receptorImmunologyReceptorBiologyViral diseaseInternal medicineGeneticsGeneViral load

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In patients receiving highly active antiretroviral therapy (HAART), antiretroviral drug-metabolizing enzyme and transporter gene polymorphisms, as well as chemokine receptor gene polymorphisms, may influence response to treatment. METHODS: In a North American, treated, adherent human immunodeficiency virus (HIV)-positive cohort (self-identified whites, n = 175; blacks, n = 218), we investigated whether CYP2B6 (516G>T, 983T>C), UGT2B7 (IVS1+985A>G, 802C>T), MDR1 3435C>T, chemokine (C-C motif) receptor 2 (CCR2) 190G>A, and CCR5 (-2459G>A, Δ32) polymorphisms influenced the time to achieve virologic success (TVLS). RESULTS: No difference in TVLS was observed between races. In Kaplan-Meier analyses, only 516G>T (log-rank P = .045 for comparison of GG, GT, and TT and P = .02 GG + GT vs TT) and -2459G>A (log-rank P = .04 for GG, GA, and AA and P = .02 for GG + GA vs AA) genotypes were significantly associated with TVLS in black patients but not in white patients. However, in the Cox proportional hazards model that included age, sex, baseline CD4(+) T cell count, and baseline viral load, no significant association was observed between 516G>T and TVLS, whereas the association between -2459G>A and TVLS remained significant even after including CCR2 190G>A as well as all the drug-metabolizing enzyme and transporter genotypes. CONCLUSIONS: These findings suggest that CCR5 -2459G>A genotype had a strong, race-specific influence on TVLS in this cohort. Understanding the possible mechanisms underlying this influence requires further studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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