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Enregistrement W2161873970 · doi:10.1093/carcin/24.2.217

Msh2 deficiency enhances somatic Apc and p53 mutations in Apc+/-Msh2-/- mice

2003· article· en· W2161873970 sur OpenAlexaff
Kyoung‐Jin Sohn

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMSH2Germline mutationAdenomatous polyposis coliSomatic cellBiologyFamilial adenomatous polyposisCancer researchMutationDNA mismatch repairGeneCancerGeneticsDNA repairColorectal cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inactivation of the adenomatous polyposis coli (Apc) gene by loss of the wild-type Apc allele (LOH) is a prerequisite for the development of intestinal adenomas in Msh2 proficient Min (Apc+/-Msh2+/+) mice. In contrast, adenomas from Msh2 deficient Min (Apc+/-Msh2-/-) mice are not usually associated with LOH. Given the role of Msh2 in post-replicative DNA repair, this study investigated whether Msh2 deficiency enhances somatic Apc and p53 mutations in Apc+/-Msh2-/- mice. Somatic Apc mutations (5/sample) were observed in the non-neoplastic intestinal mucosa from Apc+/-Msh2-/- mice but not from Min mice, suggesting that Msh2 deficiency is associated with a hypermutable state in the intestinal mucosa from Apc+/-Msh2-/- mice. Adenomas from Apc+/-Msh2-/- mice had a 2-fold higher rate of somatic Apc mutations (10/adenoma) than the non-neoplastic intestinal mucosa (5/sample), and did not demonstrate LOH. Truncating Apc mutations were observed in 82% of the adenomas from Apc+/-Msh2-/- mice and were not observed at all in the non-neoplastic intestinal mucosa. In contrast, in Min mice, all adenomas demonstrated LOH, had significantly less numbers of somatic Apc mutations (1.8 mutations/adenoma) compared with the adenomas from Apc+/-Msh2-/- mice, and harbored no truncating Apc mutations. These observations suggest that somatic Apc mutations, and not LOH, is a likely mechanism by which the Apc gene is inactivated in the development of adenomas in Apc+/-Msh2-/- mice in contrast to Min mice. Adenomas from Apc+/-Msh2-/- mice, but not from Min mice, also harbored somatic p53 mutations (mutation frequency of 45.5%), reflecting hypermutability associated with Msh2 deficiency. The nature and frequency of somatic Apc and p53 mutations in Apc+/-Msh2-/- mice suggest that many genomic sites, in addition to genes containing simple repeated sequences, are at risk of somatic mutations associated with Msh2 deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,724

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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