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Enregistrement W2161884651 · doi:10.1038/nature11547

Pancreatic cancer genomes reveal aberrations in axon guidance pathway genes

2012· article· en· W2161884651 sur OpenAlexaff
Andrew V. Biankin, Nicola Waddell, Karin S. Kassahn, Marie‐Claude Gingras, Lakshmi Muthuswamy, Amber L. Johns, David K. Miller, Peter J. Wilson, Ann‐Marie Patch, Jianmin Wu, David K. Chang, Mark J. Cowley, Brooke Gardiner, Sarah Song, Ivon Harliwong, Senel Idrisoglu, Craig Nourse, Ehsan Nourbakhsh, Suzanne Manning, Shivangi Wani, Milena Gongora, Marina Pajic, Christopher J. Scarlett, Anthony J. Gill, Andreia V. Pinho, Ilse Rooman, Matthew J. Anderson, Oliver Holmes, Conrad Leonard, Darrin F. Taylor, Scott Wood, Qinying Xu, Kátia Nones, J. Lynn Fink, Angelika N. Christ, Timothy J. C. Bruxner, Nicole Cloonan, Gabriel Kolle, Felicity Newell, Mark Pinese, R. Scott Mead, Jeremy L. Humphris, Warren Kaplan, Marc D. Jones, Emily K. Colvin, Adnan Nagrial, Emily S. Humphrey, Angela Chou, Venessa Chin, Lorraine A. Chantrill, Amanda Mawson, Jaswinder S. Samra, James G. Kench, Jessica A. Lovell, Roger J. Daly, Neil D. Merrett, Christopher W. Toon, Krishna Epari, Nam Q. Nguyen, Andrew P. Barbour, Nikolajs Zeps, Nipun Kakkar, Fengmei Zhao, Yuan Wu, Min Wang, Donna M. Muzny, William E. Fisher, F. Charles Brunicardi, Sally E. Hodges, Jeffrey G. Reid, Jennifer Drummond, Kyle Chang, Yi Han, Lora Lewis, Huyen Dinh, Christian Buhay, Timothy A. Beck, Lee E. Timms, Michelle Sam, Kimberly Begley, Andrew Brown, Deepa Pai, Ami Panchal, Nicholas Buchner, Richard de Borja, Robert E. Denroche, Christina K. Yung, Stefano Serra, Nicole Onetto, Debabrata Mukhopadhyay, Ming‐Sound Tsao, Patricia A. Shaw, Gloria M. Petersen, Steven Gallinger, Ralph H. Hruban, Anirban Maitra, Christine A. Iacobuzio–Donahue, Richard D. Schulick, Christopher L. Wolfgang, Richard A. Morgan, Rita T. Lawlor, Paola Capelli, Vincenzo Corbo, Maria Scardoni, Giampaolo Tortora, Margaret A. Tempero, Karen M. Mann, Nancy A. Jenkins, Pedro A. Pérez–Mancera, David J. Adams, David A. Largaespada, Lodewyk F.A. Wessels, Alistair G. Rust, Lincoln Stein, David A. Tuveson, Neal G. Copeland, Elizabeth A. Musgrove, Aldo Scarpa, James R. Eshleman, Thomas J. Hudson, Robert L. Sutherland, David A. Wheeler, John V. Pearson, John D. McPherson, Richard A. Gibbs, Sean M. Grimmond

Notice bibliographique

RevueNature · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesUniversità degli Studi di VeronaGastroenterological Society of AustraliaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroQueensland GovernmentAgency for Science, Technology and ResearchNational Institutes of HealthCancer Council NSWRoyal Australasian College of PhysiciansCancer Institute NSWNational Health and Medical Research CouncilWellcome TrustCancer Research UKNational Cancer InstituteAustralian Cancer Research FoundationAustralian GovernmentNational Human Genome Research InstituteJohns Hopkins UniversityPetre FoundationRoyal College of Pathologists of AustralasiaMedical Research CouncilMinistero dello Sviluppo EconomicoCancer Prevention and Research Institute of TexasR.T. Hall TrustAmerican Association for Cancer Research
Mots-clésBiologyKRASExome sequencingGeneticsPancreatic cancerCDKN2ACarcinogenesisExomeCancer researchGeneCancerMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2 113
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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