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Enregistrement W2161965506 · doi:10.5598/imafungus.2011.02.01.14

The Amsterdam Declaration on Fungal Nomenclature

2011· article· en· W2161965506 sur OpenAlexaff
David L. Hawksworth, P.W. Crous, Scott A. Redhead, Don R. Reynolds, Robert A. Samson, Keith A. Seifert, John W. Taylor, Michael J. Wingfield, Özlem Abacı, Catherine Aime, Ahmet Asan, Feng‐Yan Bai, Z. Wilhelm de Beer, Dominik Begerow, Derya Berikten, Teun Boekhout, Peter Buchanan, Treena I. Burgess, Walter Buzina, Lei Cai, P. F. Cannon, J. L. Crane, Ulrike Damm, Heide-Marie Daniel, Anne D. van Diepeningen, Irina S. Druzhinina, Paul S. Dyer, Ursula Eberhardt, Jack W. Fell, Jens C. Frisvad, David M. Geiser, József Geml, Chirlei Glienke, Tom Gräfenhan, J.Z. Groenewald, Marizeth Groenewald, J. de Gruyter, Eveline Guého-Kellermann, Liang‐Dong Guo, David S. Hibbett, Seung‐Beom Hong, Sybren de Hoog, Jos Houbraken, Sabine M. Huhndorf, Kevin D. Hyde, Ahmed Mahmoud Ismail, Peter R. Johnston, Duygu Göksay Kadaifçiler, Paul M. Kirk, Urmas Kõljalg, Cletus P. Kurtzman, Paul-Emile Lagneau, C. André Lévesque, Xingzhong Liu, Lorenzo Lombard, Wieland Meyer, Andrew N. Miller, D. W. Minter, Mohammad Javad Najafzadeh, Lorelei L. Norvell, S. M. Ozerskaya, Rasime Öziç, Shaun R. Pennycook, Stephen W. Peterson, Olga Vinnere Pettersson, William Quaedvlieg, Vincent A. R. G. Robert, Constantino Ruibal, Johan Schnürer, Hans‐Josef Schroers, Roger G. Shivas, Bernard Slippers, Henk Spierenburg, Masako Takashima, Evrim Taşkoin, Marco Thines, Ulf Thrane, Alev Haliki Uztan, M. van Raak, János Varga, Aida Vasco, G.J.M. Verkley, S.I.R. Videira, Ronald P. de Vries, Bevan Weir, Neriman Yılmaz, Andrey Yurkov, Ning Zhang

Notice bibliographique

RevueIMA Fungus · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesKoninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen
Mots-clésNomenclatureDeclarationPolitical scienceLibrary scienceComputer scienceBiologyLawTaxonomy (biology)Zoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Amsterdam Declaration on Fungal Nomenclature was agreed at an international symposium convened in Amsterdam on 19-20 April 2011 under the auspices of the International Commission on the Taxonomy of Fungi (ICTF). The purpose of the symposium was to address the issue of whether or how the current system of naming pleomorphic fungi should be maintained or changed now that molecular data are routinely available. The issue is urgent as mycologists currently follow different practices, and no consensus was achieved by a Special Committee appointed in 2005 by the International Botanical Congress to advise on the problem. The Declaration recognizes the need for an orderly transitition to a single-name nomenclatural system for all fungi, and to provide mechanisms to protect names that otherwise then become endangered. That is, meaning that priority should be given to the first described name, except where that is a younger name in general use when the first author to select a name of a pleomorphic monophyletic genus is to be followed, and suggests controversial cases are referred to a body, such as the ICTF, which will report to the Committee for Fungi. If appropriate, the ICTF could be mandated to promote the implementation of the Declaration. In addition, but not forming part of the Declaration, are reports of discussions held during the symposium on the governance of the nomenclature of fungi, and the naming of fungi known only from an environmental nucleic acid sequence in particular. Possible amendments to the Draft BioCode (2011) to allow for the needs of mycologists are suggested for further consideration, and a possible example of how a fungus only known from the environment might be described is presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0130,005
Science ouverte0,0030,006
Intégrité de la recherche0,0070,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0430,038

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations409
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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