The Classic Basic Protein of Myelin – Conserved Structural Motifs and the Dynamic Molecular Barcode Involved in Membrane Adhesion and Protein-Protein Interactions
Notice bibliographique
Résumé
The myelin basic protein (MBP) family comprises a variety of developmentally-regulated members arising from different transcription start sites, differential splicing, and post-translational modifications. The "classic" isoforms of MBP include the 18.5 kDa form, which predominates in adult human myelin and facilitates compaction of the mature myelin sheath in the central nervous system, thereby maintaining its structural integrity. In addition to membrane-association, the 18.5 kDa and all other classic isoforms are able to interact with a multitude of proteins, including Ca(2+)-calmodulin, actin, tubulin, and SH3-domain containing proteins, and thus may be signalling linkers during myelin development and remodelling. All proteins in this family are intrinsically disordered, creating a large effective surface to facilitate multiple protein associations, and are post-translationally modified to various degrees by methylation, phosphorylation, and deimination. We have used spectroscopic (fluorescence, CD, EPR, and NMR) approaches to study MBP's conformational adaptability. A highly-conserved central domain presents an amphipathic alpha-helix in association with a phospholipid membrane, and contains a threonyl residue that is phosphorylated by MAP-kinases. In multiple sclerosis, this segment represents a primary immunodominant epitope. This helical structure is adjacent to a proline-rich region that presents a classic SH3-ligand, comprises a second MAP-kinase phosphorylation site, and forms a polyproline type II helix. This domain of the protein is thus essential to proper positioning of a protein-interaction motif, with the local conformation and accessibility being modulated by MAP-kinases. In addition, the C-terminus of 18.5 kDa MBP has been identified by NMR spectroscopy as a Ca(2+)-calmodulin-binding site, and is of note for having a high density of post-translational modifications (protein kinase C phosphorylation, and deimination). For the most part, any classic protein isoform functions as an entropic spring that interacts in its entirety with membranes and cytoskeletal proteins, but the central and C-terminal motifs may represent molecular switches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».