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Enregistrement W2162059849 · doi:10.1139/w09-044

Enhancement of surfactin production of <i>Bacillus subtilis</i> fmbR by replacement of the native promoter with the Pspac promoter

2009· article· en· W2162059849 sur OpenAlexvenueno aff
Huigang Sun, Xiaomei Bie, Fengxia Lü, Yaping Lu, Yundailai Wu, Zhaoxin Lu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurfactinBacillus subtilisRecombinant DNAOperonStrain (injury)Wild typeMicrobiologyBacillalesBacillaceaeChemistryPromoterPlasmidBiologyEscherichia coliLipopeptideMolecular biologyGeneBiochemistryMutantBacteriaGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacillus subtilis fmbR-1 was obtained from wild-type B. subtilis fmbR by replacement of the native promoter of the surfactin operon with the inducible promoter Pspac. The recombinant B. subtilis fmbR-1 produced more antibacterial substances than the wild-type strain. The overproducing phenotype was related to the enhancement of antagonistic activities against Bacillus cereus. HPLC peaks of surfactin for recombinant fmbR-1 showed patterns of lipopeptides similar to those of the wild-type strain, and surfactin production of the recombinant fmbR-1 was up to about fivefold greater than that of the wild-type strain without induction by isopropyl beta--1-thiogalactopyranoside. However, the production of surfactin increased to about 10-fold more than that of the wild-type strain when it was induced by isopropyl beta--1-thiogalactopyranoside.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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