Ranking the Binding Energies of p53 Mutant Activators and Their ADMET Properties
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The guardian of the genome, p53, is the most mutated protein found in all cancer cells. Restoration of wild-type activity to mutant p53 offers promise to eradicate cancer cells using novel pharmacological agents. Several molecules have already been found to activate mutant p53. While the exact mechanism of action of these compounds has not been fully understood, a transiently open pocket has been identified in some mutants. In our study, we docked twelve known activators to p53 into the open pocket to further understand their mechanism of action and rank the best binders. In addition, we predicted the absorption, distribution, metabolism, excretion and toxicity properties of these compounds to assess their pharmaceutical usefulness. Our studies showed that alkylating ligands do not all bind at the same position, probably due to their varying sizes. In addition, we found that non-alkylating ligands are capable of binding at the same pocket and directly interacting with Cys124. The comparison of the different ligands demonstrates that stictic acid has a great potential as a p53 activator in terms of less adverse effects although it has poorer pharmacokinetic properties.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle