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Enregistrement W2162191812 · doi:10.5539/jas.v2n4p30

Molecular Characterization and Evolutionary Analysis of Alpha-gliadin Genes from Eremopyrum bonaepartis (Triticeae)

2010· article· en· W2162191812 sur OpenAlexvenueno aff
Guangrong Li, Tao Zhang, Yirong Ban

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTriticeaeGliadinPseudogeneGeneBiologyGeneticsPhylogenetic treeGenomeAmino acidSequence analysisEpitopeExonBiochemistryAntigenGluten

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Total 16 ?-gliadin gene sequences ranged from 1186 to 1316bp were isolated from Eremopyrum bonaepartis byPCR based strategy. Analysis of deduced amino acid sequences indicated that 8 of 16 sequences displayed thetypical structure of ?-gliadin genes with six cysteine residues, while the other 8 sequences contained in-framestop codon, and were therefore pseudogenes. Phylogenetic analysis based on the variation of ?-gliadin genesequences indicated that the F genome of E. bonaepartis was apparently differed from the A, B and D genomesof wheat. Four peptides, Glia-?, Glia-?2, Glia-?9 and Glia-?20, which have been identified as T cell stimulatoryepitopes in celiac disease (CD) patients through binding to HLA-DQ2/8, were searched to the E. bonaepartis?-gliadin gene sequences. We firstly found that only Glia-? existed in 7 of 8 full sequences, the fact suggestingthat the occurrence of the stimulatory epitopes in ?-gliadin genes was newly evolved in wheat.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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