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Enregistrement W2162201862 · doi:10.1139/w09-091

Rapid method for extracting the antibiotic mutacin 1140 from complex fermentation medium yeast extract

2009· article· en· W2162201862 sur OpenAlexvenueno aff
Noel Chaney, Shawanda Wilson-Stanford, James Kastrantas, Neeti Dahal, Leif Smith

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLantibioticsNisinAmmonium sulfate precipitationYeastFermentationYeast extractChromatographyBacteriocinBiochemistryAntibioticsChemistryAmmonium sulfateBioassayBiologyMicrobiologyEnzymeSize-exclusion chromatographyAntimicrobial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The peptide antibiotic mutacin 1140 belongs to the group of antibiotics called lantibiotics. They are ribosomally synthesized and undergo extensive enzymatic modifications before being excreted into the culture medium. By using reverse-phase-high-performance liquid chromatography (RP-HPLC) and a semiquantitative bacteriocin bioassay to track mutacin 1140, an efficient ammonium sulfate (AS) precipitation method has been developed for removing mutacin 1140 from a complex medium containing 5% yeast extract. This method minimizes the amounts of fermentation by-products and media components that make downstream purification processes more difficult and economically infeasible. The method may be adaptable for the initial purification step of other lantibiotics. A threefold decrease in the precipitation of the medium components found in yeast extract, at pH 8.0 vs. pH 2.0, may have broad utility for the isolation of secondary metabolites produced in this complex medium. The average yield of mutacin 1140 from the fermentation medium was determined as 66%.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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