Androgen receptor gene exon 1 CAG repeat polymorphism in Finnish patients with childhood-onset type 1 diabetes
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Animal models suggest that androgen receptor gene polymorphisms might affect disease predisposition in human immune-mediated diabetes. The aim of this study was to investigate the effect of the human androgen receptor gene exon 1 CAG repeat polymorphisms on type 1 diabetes (T1D) susceptibility. DESIGN AND METHODS: A combined strategy of case-control and family-based approaches was used. Affected sibling pair families (n=120), nuclear families (n=645) and cohorts of sporadic cases (n=208) and controls (n=1381) were genotyped for androgen receptor gene exon 1 CAG repeat polymorphism. An automated fluorescence-based DNA fragment-sizing method was used. RESULTS: The distribution of CAG repeat alleles did not differ significantly between patients and controls. However, short repeat alleles (7-14) were more prevalent among cases in girls compared with controls (8.77% vs 5.91%; P=0.03). Long repeat alleles (19-28) were less frequent among HLA DR3-positive diseased boys than in DR3-positive control boys (32.6% vs 40.6%; P=0.011). The differences were not significant after adjustment for multiple comparisons. Transmission of CAG repeat alleles was not different from expected in the total material. However, transmissions to girls deviated from the expected value significantly (extended transmission disequilibrium test (ETDT) 37.82; P=0.0016). A decreased transmission of the alleles with 13, 20 and 26 repeats to girls was observed (T%0, P=0.046; T%25.5, P=0.0003, T%0, P=0.025). CONCLUSION: The results do not support a common role for the androgen receptor gene exon 1 CAG repeat in T1D susceptibility; however, an effect of a disease variant in linkage disequilibrium could be detected.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».