MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2162342299 · doi:10.1186/1477-5956-10-73

Wounding, insect chewing and phloem sap feeding differentially alter the leaf proteome of potato, Solanum tuberosum L.

2012· article· en· W2162342299 sur OpenAlexafffund
Marc‐Olivier Duceppe, Conrad Cloutier, Dominique Michaud

Notice bibliographique

RevueProteome Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect-Plant Interactions and Control
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les TechnologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de SherbrookeAgricultural Research ServiceUniversité LavalU.S. Department of Agriculture
Mots-clésColorado potato beetleBiologyProteomePhloemSolanum tuberosumPlant defense against herbivoryAphidLeptinotarsaBotanyPhotosynthesisInsectHerbivoreProteomicsMacrosiphum euphorbiaeEffectorGeneBiochemistryPEST analysisAphididae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Various factors shape the response of plants to herbivorous insects, including wounding patterns, specific chemical effectors and feeding habits of the attacking herbivore. Here we performed a comparative proteomic analysis of the plant's response to wounding and herbivory, using as a model potato plants (Solanum tuberosum L.) subjected to mechanical wounding, defoliation by the Colorado potato beetle Leptinotarsa decemlineata Say, or phloem sap feeding by the potato aphid Macrosiphum euphorbiae Thomas. RESULTS: Out of ~500 leaf proteins monitored by two-dimensional gel electrophoresis (2-DE), 31 were up- or downregulated by at least one stress treatment compared to healthy control plants. Of these proteins, 29 were regulated by beetle chewing, 8 by wounding and 8 by aphid feeding. Some proteins were up- or downregulated by two different treatments, while others showed diverging expression patterns in response to different treatments. A number of modulated proteins identified by mass spectrometry were typical defense proteins, including wound-inducible protease inhibitors and pathogenesis-related proteins. Proteins involved in photosynthesis were also modulated, notably by potato beetle feeding inducing a strong decrease of some photosystem I proteins. Quantitative RT PCR assays were performed with nucleotide primers for photosynthesis-related proteins to assess the impact of wounding and herbivory at the gene level. Whereas different, sometimes divergent, responses were observed at the proteome level in response to wounding and potato beetle feeding, downregulating effects were systematically observed for both treatments at the transcriptional level. CONCLUSIONS: These observations illustrate the differential impacts of wounding and insect herbivory on defense- and photosynthesis-related components of the potato leaf proteome, likely associated with the perception of distinct physical and chemical cues in planta.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,390
Score d'incertitude au seuil0,702

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProteome ScienceMême sujetInsect-Plant Interactions and ControlTravaux en français237 207